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摘要:1、安装后首先打开ImageJ:2、打开要分析图片:File>open  (热键为 Ctrl+O )3、转换成8bit的灰度图:Image>Type>8­bit4、黑白反转(因为对于光密度(OD)来说越白数值越小,纯白为0;越黑数值越大,纯黑理论上是无限大。因此我们需要将上一步所转换的灰度图进行黑白反转,不然的话测出来的数值就会荧光越亮反而数值越小): Edit>Invert (热键为 Ctrl+Shift+I )5、校正光密度(软件默认为测量灰度,因此我们要改为更加适用的光密度,其中原理不是一两句话能说得清的,这里忽略):Analyze>Calibrate在弹出来的界面的Function选择Uncalibrated OD,并下界面左下方勾选Global calibration,然后点击右下角的OK点击OK后会跳出校正后的光密度曲线:如不勾选Global calibration,光密度的校正只对这张图片有效,一般分析都要分析多张图片,所以需要勾选,勾选后在打开另一图片时会提示是否将此校正应用于所有图片,不勾选Disable Global Calibration,勾选Disablethese Messages6、选择测量单位(一般选择象素,如有明确的比例,也可以选择相应单位):Analyze>Set scale点击后在弹出的界面里点击中间的 click to Remove Scale ,并勾选下面的Global(同样的,如不选Global这个测量单位的选择只对这张图片有效),最后点击OK7、选择测量项目:Analyze>Set Measurements在弹

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